PDx-Pop 是 NONMEM 的配套图形界面®

PDx-Pop 软件与现有工具及其自动化方法无缝集成,以加快群体药代动力学建模和分析的迭代过程。

与 NONMEM 协同工作®,群体药代动力学和药代动力学-药效学模型中的 “黄金标准”,R 和/或 S-Plus®用于图形和统计以及 MS Word®和 Excel®PDx-Pop 可在 Windows 、 Linux 和 Mac 操作系统中使用,它提供了最佳的灵活性,提高了效率和功能。

PDx-Pop 5.2 与 NONMEM 7.3 及更高版本完全兼容和协同

新的或改进的 PDx-Pop 5.2

  • 高级 NONMEM 7.3 使用命令行文本框将参数作为复选框运行
  • 增强的多估计方法运行的运行选项-轻轻地停止单个或批量的控制流运行,跳到下一个估计方法,选择在运行中显示数值迭代或不显示。
  • NONMEM 7.3 短期语法 (例如 $ OMEGA 值 (0.2,0.001) 和 $ THETA (0,2,100) x5) 可以由 Pdx-Pop 解释。
  • 标准化视觉预测检查和预测修正预测检查增加
  • 引导评估采用 NONMEM 7.3 的分层引导方法,并跨多个 CPU 分析作业。
  • 诊断总结统计和贝叶斯分析图包含多分位数值和位置 (2.5 、 5 、 10 、 25 、 50 、 75 、 90 、 95 、 97.5%)。
  • 控制流文件向导允许轻松使用 PK 和用户模型的新估计选项。
  • 轻松实现 NONMEM 7.2 中引入的 NONMEM 运行的 MPI 或 FPI 并行化。
  • 多达 100 个 CPU 可用于多 CPU 问题
  • 完全可控的 PDx-Pop 图形用户界面的外观和感觉,允许调色板和字体大小的变化
  • 使用键盘快捷键轻松访问配置编辑器
  • 使用键盘快捷键或鼠标点击方便切换 R 和 S-Plus
  • 同时为所有评估方法创建 R 和 S-Plus 图
  • 能够安装并注册过去的 (NONMEM 7.1.2) 以在未来的 NONMEM (NONMEM 7.9.0) 版本中显示 (NONMEM 7.3.0)

数据管理接口

  • 在 MS Excel 或 R/S-Plus 中快速查看、编辑或绘制数据集,以便对数据进行初步探索
  • 轻松执行数据集的单个拆分,为建模和模型验证步骤创建索引和验证数据集,或为模型评估方法创建多个拆分

建模接口

  • 通过 PDx-Pop GUI 实现 NONMEM 7.3 额外的命令行参数-在 PDx-Pop 5.2 中改进的都是 NONMEM 7.3 额外的命令行参数
  • 用于控制 MPI 和 FPI 并行计算的 NONMEM “parafiles” 向导
  • 在多核系统上并行运行批处理以节省时间
  • 创建、排序、查看、编辑或复制控制流
  • 使用控制流向导或使用标准模板自动创建控制流文件并防止错误
  • 点击鼠标即可轻松选择、优先排序和编译要运行的控制流: 单独运行或批量运行
  • 通过查看中间结果特征或实时绘制目标函数值或任何模型参数作为迭代次数的函数来完成分析之前的查看进度

输出接口

  • 不从 PDx-Pop 运行的进程后 NONMEM 输出,便于访问 PDx-Pop 图形和统计方法
  • 更有效地利用输出、执行分析、应用 R/S-Plus 和 MS Excel 函数

输出以旨在简化分析和报告过程的格式产生:

  • 使用的控制流的附加信息的标准 NONMEM 结果
  • 增强输出汇总结果: 包括最终估计的 θ,ω 和 σ 及其相关的标准偏差,% CV,% RSE,区间,AIC 和 SBC
  • 使用 R/S-Plus 或 MS Excel 的全自动诊断图
  • 自动 R/S-Plus 图的估计参数 (qqplots,直方图) 和 etas (对图,直方图)
  • 两次运行之间的自动 R/S-Plus 绘图比较
  • 自动贝叶斯参数历史图
  • 从 PDx-Pop 访问自定义用户编写的 R/S-Plus 脚本

模型评估接口

  • WALD 近似方法的实施有助于协变量模型的建立 -- 在 PDx-Pop 5.2 中改进以在多 CPU 模式下运行
  • 自动引导分析以确定参数间隔 -- 在 PDx-Pop 5.2 中改进以在多 CPU 模式下运行; 在 PDx-Pop 5.2 中进行了改进,以访问 NONMEM 的 $ SIM 引导功能及其所有参数,例如 STRAT 和 STRATF 等
  • 自动目标函数和确定非对称置信区间
  • 自动杠杆分析以确定模型的稳定性和非典型个体的影响 -- 在 PDx-Pop 5.2 中改进以在多 CPU 模式下运行
  • 自动随机初始参数估计变化 -- 在 PDx-Pop 5.2 中改进,以在多 CPU 模式下运行
  • 自动视觉预测检查实现
  • 自动化多 MCMC 链-在 PDx-Pop 5.2 中改进,可在多 CPU 模式下运行

每个新版本都在实现更多的自动化模型评估功能。

跟踪和审计跟踪

  • 运行日志跟踪分析中的所有步骤-查看、打印或将此重要信息保存为文件
  • 维护一份与分析相关的电子日志,以记录重要信息: 运行评论、使用的模型、产出决策等

工具和实用程序

  • 通过 PDx-Pop 工具栏启动 MPI 注册
  • 适用于 PDx-Pop 支持的所有编译器的图形 NONMEM 安装工具和 Fortran 编译器测试器
  • PDF 格式 PDx-Pop 用户手册、支持文档和可通过界面访问的 “工具提示”
  • 可通过接口访问 NONMEM 帮助的 HTML 和 PDF 版本
  • 系统诊断测试以排除潜在的配置问题
  • 所有标准 NONMEM 模型的 NONMEM 控制流和数据库

系统要求

以下是系统要求。

平台

  • 英特尔或 AMD 奔腾处理器,内存最小为 1 GB (Windows Vista 或 7 为 2 GB)
  • Windows XP 、 Vista 或 7 、 Linux (已测试 Ubuntu 14.04 LTS) 或 Mac OS X (已测试雪豹)
  • 显卡和显示器的最小分辨率为 1280x800
  • CD-ROM 磁盘驱动器
  • Microsoft 鼠标或其他兼容的指向设备
  • 所有必需软件的 100 MB 可用磁盘空间 (接口空间 = 25 MB)
  • ~ 100 MB 的交换空间/虚拟内存
  • Linux 和 Mac OS 版本只有 R 作为可视化工具

必需软件

  • NONMEM 7 级别 1.0 或更高
  • 英特尔 Visual Fortran * (版本 8.0 或更高),GNU g95 (版本 0.92!或更高),gfortran (版本 4.5.0 或更高)
  • MS Excel 97 或更高,Word 97 或更高
  • Internet Explorer 7.0 或更高版本或任何其他浏览器

推荐软件

  • 适用于 Windows 8.2 (或更高版本) 的 3.1.3 (或更高版本) 或 S-Plus (模型评估功能所需)
  • Xpose 4.0 代表 R 或者 3.104 代表 S-Plus
  • 英特尔 Visual Fortran 需要 Microsoft Visual Studio。

图标 plc bob体育投注的 PDx。是注册商标。NONMEM 是加州大学董事的注册商标。Windows 、 Windows Vista 、 Windows 2000 、 Windows XP 、 Microsoft Word 和 Microsoft Excel 都是微软公司的注册商标或商标。S-PLUS 是洞察力公司的注册商标。

接点

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